das vms ist ein eigeständiges scrip was auf php basiert deshalb verstehe ich nicht genau was du mitmeinst.Wenn das Anpassen an Wordpress zu aufwendig ist, würde ich es sonnst einfach an PHP anpassen..
Includen könntest du den content mit diesem befehl
<?@include_once('content'.$_GET['content'].'.php');?>
wie die menus eingefügt sind sihst du ja in der header.php
somit könntest du also das komplette design in die header.php machen und die footer.php löschen vergess dann aber nicht die bestimmten berreiche aus der index zu löschen wie zb die footer.php und den content iclude