GIF Arbeitet mit sog. Paletten. Da Gif-Bilder nur aus 256 Farben bestehen, lassen sich (is ja klar) nicht alle Farben abbilden.
Um Bilder nicht alles Ihrer Farbechtehiet zu rauben, werden in der Palette die Farben abgespeichert, die besonders häufig in einem Bild vorkommen.

Nun kann es sein, dass wenn deine Animation abgespeichert wird, Die Farbe schwarz nicht in der Palette drin is.
Du musst mal schauen, ob du die möglichkeit hast beim abspeichern, von gimp eine neue Palette erstellen zu lassen. Oder per Gif-Optimierung rumprobieren.
Oder im zweifelsfall ein anderes Programm verwenden. Da gibts von Ulead den Gifanimator.

Oder du kannst versuchen, die Farbe #000000 durch einen etwas anderen Farbwert wie #111111 zu ersetzen. Vieleicht hilft das.
Ich weiß net ob dir dieses senile rum senieren hilft.

Gruß
Benni