Nun, die Einträge bei Paidmail_empfaenger sagen ja nur aus welche mail der jeweilige User gekriegt hat und glaube (müsste ich sonst nachschauen, bin gerade nicht in meinem Server) ob die schon bestätigt wurden.

Wenn Du siehst das viele oder bestimmte User mails nicht oder nicht mehr bestätigen, dann musst Du z.B. über User-Check im Admin (wenn Du das hast) die jenigen User, welche keine Mails bestätigen mal deaktivieren

Dein Problem mit der Inbox an sich denke ich wird aber ein anderes sein

und in der Datei Mailhistory zu finden sein.

Sei es das zu viel oder nicht wirklich korrekt sortiert werden soll oder ähnliches

Welche History nutzt Du denn? gibt ja mittlerweile jede Menge von auf dem Markt